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给xiezhengwei@hsc.pku.edu.cn发信, 申请DLEPS系统权限,请注明姓名,课题组信息,等待审批通过。
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三个输入文件:
化合物文件中,SMILES一列是必须的,其它的可以没有,也可以有自定义的列
Up / down gene signatures:
在该网站,进行转换
https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/convert
文件示例,只有gene数字ID(ENTREZGENE_ACC)每个一行
Down gene signatures 可以省去
也可以使用内置的fda961与np2720库
提交后返回结果页面,
可以下载计算结果,负 score表示可以逆转up / down gene signatures
如果只是输入了 up genes, 正score表示可以激活up genes